В соответствии со статьей 9 Устава Кыргызско-Турецкого университета «Манас» Ученый совет является академическим органом университета и принимает решения по учебной и научной деятельности университета. Подробный перечень обязанностей Ученого совета излагается в статье 10 Устава университета.

В 2021/2022 учебном году состав Ученого совета университета следующий:

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

Ректор

д.т.н. проф. Кулмырзаев Асылбек

Первый проректор

д.и.н. проф. Мокеев Анварбек

Проректор

PhD. проф. Орчан Мустафа

Проректор

PhD. проф. Беше Ахмет

Декан Гуманитарного факультета

д.б.н. проф. Курманбекова Гулбубу

Декан факультета Естественных наук

доц. Ибраев Анарбек

Декан факультета Искусств

PhD. проф. Бурмаоглу Серхат

Декан факультета Экономики и Управления

PhD. проф. Полат Кемал

Декан факультета Теологии

PhD. проф. Турк Мехмет Сезаи

Декан факультета Коммуникации

PhD. проф. Кобйа Мехмет

Декан Инженерного факультета

PhD. проф. Шен Исмаил

Декан Ветеринарного факультета

PhD. проф. Дурсун Атилла

Декан Сельскохозяйственного факультета

к.п.н. проф. Джанузаков Канат

Декан факультета Спортивной науки

PhD. проф. Бойлу Йасин

Декан факультета Туризма

PhD. доц. Алтынташ Исмет

Директор института Естественных наук

PhD. проф. Ардыч Кадир

Директор института Гуманитарных наук

к.ф.н. Йурумез Режеп

Директор высшей школы Иностранных языков

PhD. и.о. доц. Вурал Махмут

Директор Профессионально-технической школы

д.ф.н. проф. Урманбетова Жылдыз

к.ф-м.н. проф. Урдалетова Анаркуль

PhD. проф. Акенгин Чагатай

к.э.н. проф. Пиримбаев Жусуп

PhD. проф. Татлы Бекир

доц. Мамбетакунов Молдосейит

к.т.н. доц. Боркоев Бакыт

PhD. доц. Туркчапар Унал

PhD. доц. Шимшек Гунтекин

д.в.н. проф. Тулобаев Аскарбек

PhD. доц. Гoчмен Хусейин

PhD. доц. Озгул Октай

И.о. Генерального секретаря-Ученый секретарь